Pourquoi retrouve-t-on des nouvelles espèces en France ?

Réponse L'apport de la génétique et l'isolement des bassins de l'Adour et de la Garonne depuis des millions d'années.

Il y a deux façons de comprendre cette question, et par conséquent, deux façons d’y répondre.

1 - Redécouverte de notre ichtyofaune à l’aide des nouvelles technologies

On croyait la taxonomie des poissons d’eau douce français résolue après les travaux de Keith et Allardi qui ont eu l’ambition de cartographier la répartition des espèces françaises dans les années 90 à 2000 (Allardi et Keith, 1991 ; Keith et Allardi, 2001). On comptait alors 83 espèces en 2001. Mais à partir des années 90, il y a l'émergence de nouvelles techniques qui peuvent être mises au service de la taxonomie :

• Le matériel informatique est plus puissant et plus accessible facilitant le stockage, le transfert, l’analyse des données et permettant l’analyse morphométrique assistée par ordinateur.
• Le séquençage ADN est bon marché et son utilisation massive devient indispensable à la discipline. On a dès lors, l’émergence de la taxonomie moléculaire.

Kottelat et Freyhof utilisent ces nouveaux outils pour faire une révision taxonomique complète sur les espèces déjà connues et publie en 2007 un livre sur les poissons d’eau douce d’Europe (Kottelat, Maurice, et Jörg Freyhof. Handbook of European Freshwater Fishes. Cornol: Publications Kottelat, 2007.). La finesse des données génétiques permet de découvrir que ce qu’on considérait jusque-là comme une seule espèce était en fait le regroupement de plusieurs espèces (exemple, le chevesne est divisé en deux espèces : le chevesne et le chevesne catalan). Ce travail a beaucoup résonné dans la communauté scientifique et a inspiré d’autres travaux de recherches pour réviser les espèces connues. Aujourd’hui, on compte plus de 120 espèces (Keith et al., 2020). Et cette liste est encore amenée à évoluer dans les années à venir, car il reste encore du travail de révision. Il y a eu une attention particulière pour le Sud-Ouest, mais d’autres régions de France doivent être réétudiées.

2 – Des espèces différentes des autres espèces françaises du fait de la biogéographie de la région

L’Adour et la Garonne sont les deux principaux bassins versant du Sud-Ouest de la France avec la Charente, et comptent parmi les 8 grands bassins hydrographiques qui s’étendent en France. Un bassin versant doit être considéré comme une "île" d'eau douce entourée de terre et de mer. Ainsi, un poissons vivant dans la Garonne par exemple ne peut se déplacer vers un autre bassin, hormis s'il s'agit d'un migrateur amphihalin (espèce faisait son cycle de vie en mer et en eau douce).

Cet isolement n'est pas récent. Le réseau hydrographique français a subi de multiples événements géologiques et climatiques ces 5 derniers millions d'années : orogenèse des Alpes et des Pyrénéens, fossé d’effondrement avec capture de bassin versant, glaciations, etc. La dernière connexion connue entre la Garonne et la Loire remonte à 4,5 millions d’années (Persat et al., 2020); soit plus ancien que Lucy l'australopithèque (-3.2 Ma). La dernière connexion entre l’Adour et la Garonne remonte quant à elle aux alentours de 2 millions d’années, bien qu'elle soit encore aujourd'hui assez méconnue (Persat et al., 2020). Ainsi les espèces ont évolué chacune de leur côté durant tout ce temps (spéciation de type allopatrique) expliquant donc la forte endémicité des espèces du Sud-Ouest de la France et la présence de deux ichtyofaunes distinctes. Un autre événement majeur s'est produit à partir du début du Pléistocène (-2 Ma) : les glaciations quaternaires, qui sontsurvenues épisodiquement jusqu'au début de l'Holocène (- 10 000 ans). Au dernier maximum glaciaire, le Würm, la calotte glaciaire s'étendait jusqu'en Angleterre et la partie de la France au Nord de l'estuaire de la Gironde était du permafrost (Vandenberghe et al., 2014; Persat et al., 2020). Le Sud-Ouest de la France était alors une zone refuge avec un climat tempéré. Tandis qu'au Nord, les espèces n'ayant pas supporté les températures glaciales ont été remplacées par une faune septentrionale en provenance du Nord-Est de l'Europe (Denys, 2015; Persat et al., 2020). Ainsi, la faune ichtyologique du Sud-Ouest de la France était présente bien avant que la majorité des espèces n'arrivent en France, il y a environ 15 000 ans. Ces glaciations ont aussi pu connecter des bassins versants entre eux avec l'abaissement du niveau marin, entre l'Adour et la Cantabrie (Pays basque espagnol) par exemple. Et la fonte du glacier pyrénéen durant des épisodes interglaciaires a pu permettre au brochet aquitain de coloniser d'autres bassins versants avoisinant en longeant la côte (Keith et al., 2020).